Военно-морской инженерный институт (ВМИИ) имеет Лицензию Федеральной службы в сфере образования и науки Российской Федерации на право осуществления образовательной деятельности по Государственным образовательным стандартам высшего и среднего профессионального образования № 2414 от 23.06.2009 г. (срок действия лицензии по 12 января 2014 г.) и Свидетельство о государственной аккредитации № 2232 от 17.07.2009 г. (срок действия Свидетельства по 17 июля 2014 г.)