1-й факультет - Штурманско-гидрографический;
2-й факультет - Вооружения подводных лодок;
3-й факультет - Вооружения надводных кораблей;
4-й факультет - Среднего профессионального образования;
5-й факультет - Специальный факультет;
6-й факультет - Факультет профессиональной подготовки военнослужащих, увольняемых с военной службы.